RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 APBB1O00213 710 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 SRGAP3O43295 1099 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 DCTPP1Q9H773 170 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 LY75O60449 1722 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 RREB1Q92766 1687 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF827Q17R98 1081 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 SUSD4Q5VX71 490 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 SSH3Q8TE77 659 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 POLA2Q14181 598 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 NARFQ9UHQ1 456 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 HMMRO75330 724 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 FOXO4P98177 505 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 GCC1Q96CN9 775 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 LNPKQ9C0E8 428 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 RFC4P35249 363 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 NUCB1Q02818 461 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 MTX1Q13505 466 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 C4BP0C0L5 1744 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 ZPR1O75312 459 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 AKT1S1Q96B36 256 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPN3-209ENST00000466222 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 NTSR2O95665 410 aa23■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 SSFA2P28290 1259 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 SIL1Q9H173 461 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 PARP10Q53GL7 1025 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 ADRA2BP18089 450 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 GYS1P13807 737 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 SETDB2Q96T68 719 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPN3-209ENST00000466222 NFIXQ14938 502 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 ERFEQ4G0M1 354 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 CSF1RP07333 972 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 BAG6P46379 1132 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 CTSWP56202 376 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 GREM2Q9H772 168 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPN3-209ENST00000466222 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.92■■□□□ 1.26
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