RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RREB1Q92766 1687 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPS6KA4O75676 772 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHF14O94880 888 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.02□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C4BP0C0L5 1744 aa8.01□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLSCR1O15162 318 aa8.01□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HMMRO75330 724 aa8.01□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.01□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SKAP1Q86WV1 359 aa8.01□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.01□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CAMTA2O94983 1202 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRR29P0C7W0 189 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AMIGO3Q86WK7 504 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SUCLG2Q96I99 432 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ISCA1Q9BUE6 129 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCL11AQ9H165 835 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUP98P52948 1817 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UTYO14607 1347 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PITPNM1O00562 1244 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZPR1O75312 459 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATP8B2P98198 1209 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLEC11AQ9Y240 323 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM177BA6PVY3 158 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 APBB1O00213 710 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SRGAP3O43295 1099 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RFC4P35249 363 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NLRP10Q86W26 655 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM89AQ96GI7 184 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.99□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 H7C1W4 665 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RGS3P49796 1198 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMC5Q8IY18 1101 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GCC1Q96CN9 775 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KAZALD1Q96I82 304 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NARFQ9UHQ1 456 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CASP7P55210 303 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SYNE4Q8N205 404 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DCTPP1Q9H773 170 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.98□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SSH3Q8TE77 659 aa7.97□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LNPKQ9C0E8 428 aa7.97□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.97□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SSFA2P28290 1259 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUCB1Q02818 461 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MTX1Q13505 466 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF827Q17R98 1081 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SUSD4Q5VX71 490 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCORQ6W2J9 1755 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BAG6P46379 1132 aa7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FOXO4P98177 505 aa7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PARP10Q53GL7 1025 aa7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SETDB2Q96T68 719 aa7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C4AP0C0L4 1744 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms