RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	INPP5B	P32019	993 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	IGF1R	P08069	1367 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	FAM13A	O94988	1023 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	CTBS	Q01459	385 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		7.53	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
CLK1-208	ENST00000464454	ARAF	P10398	606 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ZAP70	P43403	619 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	STRN4	Q9NRL3	753 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	NPR3	P17342	541 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	SERPINB4	P48594	390 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454		H3BRB1	525 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	OPLAH	O14841	1288 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ICMT	O60725	284 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	PCSK2	P16519	638 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	MPST	P25325	297 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ADH6	P28332	368 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	C2CD2L	O14523	706 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	CCIN	Q13939	588 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	EGFR	P00533	1210 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	AAMP	Q13685	434 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB39	O15060	712 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	SIN3B	O75182	1162 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ACD	Q96AP0	544 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CLK1-208	ENST00000464454	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	XYLB	O75191	536 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	BCR	P11274	1271 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	USP5	P45974	858 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	GPR152	Q8TDT2	470 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	BHMT	Q93088	406 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	ATCAY	Q86WG3	371 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	EDEM1	Q92611	657 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	OIP5	O43482	229 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	PDGFA	P04085	211 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	NFKB1	P19838	968 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	PCSK7	Q16549	785 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CLK1-208	ENST00000464454	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.44	□□□□□ -1.22

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