RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 ERFEQ4G0M1 354 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 NTSR2O95665 410 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 FLIIQ13045 1269 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 SOGA3Q5TF21 947 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 MYD88Q99836 296 aa26.25■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.24■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 NUP98P52948 1817 aa26.23■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.22■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.21■■□□□ 1.79
IMP4-209ENST00000462357 CRY2Q49AN0 593 aa26.2■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.19■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.19■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.18■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 G2E3Q7L622 706 aa26.18■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 FAM89AQ96GI7 184 aa26.17■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.17■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.16■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 C21orf2O43822 256 aa26.15■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 LINS1Q8NG48 757 aa26.15■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 ABCC12Q96J65 1359 aa26.15■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.14■■□□□ 1.78
IMP4-209ENST00000462357 PTPRCP08575 1304 aa26.14■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 CCDC93Q567U6 631 aa26.13■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.13■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.13■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 ADCY9O60503 1353 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 BBOX1O75936 387 aa26.12■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 CACNA1FO60840 1977 aa26.11■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.11■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 TMC4Q7Z404 712 aa26.11■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.11■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 PDE8AO60658 829 aa26.1■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.1■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 IGKV5-2P06315 115 aa26.09■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 LMNB1P20700 586 aa26.09■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.09■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.09■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 UTRNP46939 3433 aa26.09■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 GCKRQ14397 625 aa26.08■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.08■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.08■■□□□ 1.77
IMP4-209ENST00000462357 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 SYNE4Q8N205 404 aa26.07■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.07■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.07■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.06■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 ALDH1L1O75891 902 aa26.06■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.06■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 F6X3S4 739 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 H7C1W4 665 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 GRAPQ13588 217 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 RNF181Q9P0P0 153 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 CHD4Q14839 1912 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 BEND3Q5T5X7 828 aa26.04■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.04■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
IMP4-209ENST00000462357 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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