RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.04■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.04■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.04■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 ABCC12Q96J65 1359 aa27.04■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 NLRP10Q86W26 655 aa27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 NLRP3Q96P20 1036 aa27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-204ENST00000462123 IL16Q14005 1332 aa27.01■■□□□ 1.91
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SIKE1-204ENST00000462123 WWC1Q8IX03 1113 aa27■■□□□ 1.91
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SIKE1-204ENST00000462123 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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SIKE1-204ENST00000462123 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 NUP98P52948 1817 aa26.96■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.96■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 PSMD1Q99460 953 aa26.96■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.96■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 RRAGCQ9HB90 399 aa26.96■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.95■■□□□ 1.91
SIKE1-204ENST00000462123 FSTL1Q12841 308 aa26.95■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.95■■□□□ 1.9
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SIKE1-204ENST00000462123 WDR63Q8IWG1 891 aa26.93■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.92■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 GOLGA2Q08379 1002 aa26.92■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 BBOX1O75936 387 aa26.91■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.91■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 SNED1Q8TER0 1413 aa26.9■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 SYNE4Q8N205 404 aa26.9■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
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SIKE1-204ENST00000462123 VPS33BQ9H267 617 aa26.89■■□□□ 1.9
SIKE1-204ENST00000462123 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
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SIKE1-204ENST00000462123 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.88■■□□□ 1.89
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SIKE1-204ENST00000462123 TMC4Q7Z404 712 aa26.87■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 TSPYL6Q8N831 410 aa26.87■■□□□ 1.89
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SIKE1-204ENST00000462123 SP8Q8IXZ3 490 aa26.85■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.85■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 STK31Q9BXU1 1019 aa26.85■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.84■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 FZD9O00144 591 aa26.84■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 JDP2Q8WYK2 163 aa26.84■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 ABCC4O15439 1325 aa26.84■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.83■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 GRAPQ13588 217 aa26.83■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 FAM89AQ96GI7 184 aa26.83■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SIKE1-204ENST00000462123 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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SIKE1-204ENST00000462123 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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SIKE1-204ENST00000462123 WDR90Q96KV7 1748 aa26.8■■□□□ 1.88
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SIKE1-204ENST00000462123 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.79■■□□□ 1.88
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SIKE1-204ENST00000462123 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.79■■□□□ 1.88
SIKE1-204ENST00000462123 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.79■■□□□ 1.88
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SIKE1-204ENST00000462123 MYD88Q99836 296 aa26.78■■□□□ 1.88
SIKE1-204ENST00000462123 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SIKE1-204ENST00000462123 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.77■■□□□ 1.88
SIKE1-204ENST00000462123 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SIKE1-204ENST00000462123 SLC4A2P04920 1241 aa26.76■■□□□ 1.87
SIKE1-204ENST00000462123 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SIKE1-204ENST00000462123 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.76■■□□□ 1.87
SIKE1-204ENST00000462123 MPNDQ8N594 471 aa26.76■■□□□ 1.87
SIKE1-204ENST00000462123 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.76■■□□□ 1.87
SIKE1-204ENST00000462123 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.75■■□□□ 1.87
SIKE1-204ENST00000462123 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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