RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 NLRP10Q86W26 655 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 POLA2Q14181 598 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 TXNRD1Q16881 649 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS6KA4O75676 772 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-204ENST00000452765 C4BP0C0L5 1744 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF34Q8IZ26 560 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 FOXO4P98177 505 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 MTX1Q13505 466 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 AK7Q96M32 723 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 SUSD4Q5VX71 490 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 SIL1Q9H173 461 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.95■■□□□ 1.75
SH3BP2-204ENST00000452765 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 NARFQ9UHQ1 456 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 BCORQ6W2J9 1755 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 PLSCR1O15162 318 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 ZPR1O75312 459 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF827Q17R98 1081 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 RFC4P35249 363 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 C4AP0C0L4 1744 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM161AQ3B820 660 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 NTSR2O95665 410 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 SCN7AQ01118 1682 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 SASH1O94885 1247 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 GREM2Q9H772 168 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 ERFEQ4G0M1 354 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 C8orf34Q49A92 452 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 PARP10Q53GL7 1025 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB11FIP3O75154 756 aa25.83■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.83■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.83■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 COPRSQ9NQ92 184 aa25.83■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH3P11055 1940 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 CSF1RP07333 972 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 CTSWP56202 376 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC24Q50LG9 513 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 AKT1S1Q96B36 256 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 SETDB2Q96T68 719 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 PDE8AO60658 829 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2-204ENST00000452765 BACH2Q9BYV9 841 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.5 ms