RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SYNE4Q8N205 404 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR90Q96KV7 1748 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CEP350Q5VT06 3117 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PARP10Q53GL7 1025 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NLRP10Q86W26 655 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RRAGCQ9HB90 399 aa18.78■□□□□ 0.6
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSPYL6Q8N831 410 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL4A1P02462 1669 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL4A5P29400 1685 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC93Q567U6 631 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GLTPD2A6NH11 291 aa18.76■□□□□ 0.59
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WWC1Q8IX03 1113 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC27Q2M243 656 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SOGA3Q5TF21 947 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POTECB2RU33 542 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TOMM70O94826 608 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ALDH1B1P30837 517 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HYPKQ9NX55 129 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSPA6P17066 643 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCC4O15439 1325 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NLRP3Q96P20 1036 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CACNA1FO60840 1977 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCN4AP35499 1836 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM89AQ96GI7 184 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IL16Q14005 1332 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GOLGA2Q08379 1002 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PSMD1Q99460 953 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH3P11055 1940 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYD88Q99836 296 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LTBP1Q14766 1721 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPEF2Q9C093 1822 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 G2E3Q7L622 706 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POTEIP0CG38 1075 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POTEJP0CG39 1038 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HTRA3P83110 453 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FZD9O00144 591 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRAPQ13588 217 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FSTL1Q12841 308 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR63Q8IWG1 891 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV5-2P06315 115 aa18.6■□□□□ 0.57
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