RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FSTL1Q12841 308 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TATDN2Q93075 761 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 E9PSI1 815 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL2RBP14784 551 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD46P15529 392 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF428Q96B54 188 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PNMA3Q9UL41 463 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ITGB4P16144 1822 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf80F5H4A9 247 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFC5P40937 340 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BANK1Q8NDB2 785 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXN1O15353 648 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJB2P25686 324 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SULF1Q8IWU6 871 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POM121Q96HA1 1249 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRAGCQ9HB90 399 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPTLC1O15269 473 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNRKQ9NRH2 765 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCS1LQ9Y276 419 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WNT2BQ93097 391 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C4AP0C0L4 1744 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MEGF6O75095 1541 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABHD8Q96I13 439 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRCH3Q96II8 777 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CABP1Q9NZU7 370 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COG6Q9Y2V7 657 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.9□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP47Q96K76 1375 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A0G2JLW4 131 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GJA5P36382 358 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMAPO00193 183 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLF2Q8IX21 1173 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PALLDQ8WX93 1383 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEFLP07196 543 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DPEP1P16444 411 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFV2P19404 249 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF181Q9P0P0 153 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LILRB3O75022 631 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP10P09238 476 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LBX1P52954 281 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCL11AQ9H165 835 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KDM4AO75164 1064 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms