RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 KCNB2Q92953 911 aa17.75■□□□□ 0.43
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TOP3B-206ENST00000436282 ZNF75DP51815 510 aa17.68■□□□□ 0.42
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TOP3B-206ENST00000436282 DACT1Q9NYF0 836 aa17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 FERMT3Q86UX7 667 aa17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 ECHDC1Q9NTX5 307 aa17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 OGFRQ9NZT2 677 aa17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 RGPD2P0DJD1 1756 aa17.68■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 LRMPQ12912 555 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 CKAP2LQ8IYA6 745 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 NLRP2Q9NX02 1062 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 NPHP3Q7Z494 1330 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 USP54Q70EL1 1684 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 CREB3L3Q68CJ9 461 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 GPATCH3Q96I76 525 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM5Q9C035 493 aa17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 ADCY9O60503 1353 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 TNNT1P13805 278 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 PSMA5P28066 241 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 SLC39A6Q13433 755 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 FAM173BQ6P4H8 233 aa17.66■□□□□ 0.42
TOP3B-206ENST00000436282 EVI5LQ96CN4 794 aa17.66■□□□□ 0.42
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