RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424059.1

PMS1-209, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PMS1, Length 2,004 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-209ENST00000424059 GLMNQ92990 594 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 SFI1A8K8P3 1242 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 FURINP09958 794 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 RASA1P20936 1047 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 IGFBP4P22692 258 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 RTN1Q16799 776 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.89□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.89□□□□□ -1.63
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PMS1-209ENST00000424059 C21orf2O43822 256 aa4.88□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 BTLAQ7Z6A9 289 aa4.88□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa4.88□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 ZNF417Q8TAU3 575 aa4.88□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 FAM196BA6NMK8 535 aa4.87□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 TGFBR3LH3BV60 316 aa4.87□□□□□ -1.63
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PMS1-209ENST00000424059 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 ALBP02768 609 aa4.87□□□□□ -1.63
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PMS1-209ENST00000424059 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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PMS1-209ENST00000424059 RAC1P63000 192 aa4.85□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.85□□□□□ -1.63
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PMS1-209ENST00000424059 USP17L19D6RCP7 530 aa4.85□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 USP17L20D6RJB6 530 aa4.85□□□□□ -1.63
PMS1-209ENST00000424059 MAP3K6O95382 1288 aa4.85□□□□□ -1.63
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PMS1-209ENST00000424059 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.631e-16■■■■■ 250
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PMS1-209ENST00000424059 DOC2BQ14184 412 aa4.84□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 Q8N3U1 123 aa4.84□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 MYO19Q96H55 970 aa4.84□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 GSX2Q9BZM3 304 aa4.84□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.84□□□□□ -1.64
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PMS1-209ENST00000424059 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.81□□□□□ -1.64
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PMS1-209ENST00000424059 INPP5BP32019 993 aa4.81□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.81□□□□□ -1.64
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PMS1-209ENST00000424059 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PMS1-209ENST00000424059 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.81□□□□□ -1.64
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