RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM177BA6PVY3 158 aa22.27■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.27■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRY2Q49AN0 593 aa22.26■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNQ3O43525 872 aa22.25■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NYXQ9GZU5 481 aa22.25■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NIM1KQ8IY84 436 aa22.24■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL4A5P29400 1685 aa22.23■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.22■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS33BQ9H267 617 aa22.21■■□□□ 1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.2■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOGQ13253 232 aa22.2■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.2■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF26B4DH59 902 aa22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLFQ16534 295 aa22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF15Q8N660 670 aa22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.19■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.18■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPIP5K2O43314 1243 aa22.18■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.18■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.18■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC12Q96J65 1359 aa22.17■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.17■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.17■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.17■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.16■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.15■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.15■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.15■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.15■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.14■■□□□ 1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CXCL9Q07325 125 aa22.14■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.14■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AOC3Q16853 763 aa22.13■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.13■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.12■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKAR2BP31323 418 aa22.11■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HUNKP57058 714 aa22.11■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.11■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.1■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOX10P56693 466 aa22.1■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNIP1Q15025 636 aa22.1■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.1■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.09■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCM10Q7L590 875 aa22.09■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC102AQ96A19 550 aa22.08■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZIC5Q96T25 663 aa22.08■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.08■■□□□ 1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGMBQ6NW40 437 aa22.07■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NGEFQ8N5V2 710 aa22.07■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP3Q96P20 1036 aa22.07■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H7C1D1 291 aa22.06■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPTP24298 496 aa22.06■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUSD4Q5VX71 490 aa22.06■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.06■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.06■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.05■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP48Q86UV5 1035 aa22.05■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.05■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTSR2O95665 410 aa22.04■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC51AQ86UW1 340 aa22.04■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.04■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP53Q96M91 514 aa22.04■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDCQ9Y266 331 aa22.04■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD17O75943 681 aa22.03■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.03■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPNDQ8N594 471 aa22.03■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP98P52948 1817 aa22.03■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPA1O75762 1119 aa22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BBOX1O75936 387 aa22.02■■□□□ 1.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms