RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.86■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.86■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 MPNDQ8N594 471 aa25.86■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 KLHL34Q8N239 644 aa25.85■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.84■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.83■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 HIP1O00291 1037 aa25.83■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.83■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 PDIA6Q15084 440 aa25.83■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.83■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
TMEM200B-201ENST00000420504 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.83■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 UQCRHP07919 91 aa25.83■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 NECAB1Q8N987 351 aa25.83■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC27A2O14975 620 aa25.82■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 ADCY5O95622 1261 aa25.82■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A0D9SFI3 127 aa25.81■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 IGKV5-2P06315 115 aa25.81■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 MRC1P22897 1456 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 C5P01031 1676 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 MED23Q9ULK4 1368 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 KCNJ4P48050 445 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.8■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.79■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.79■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 RGPD5Q99666 1765 aa25.79■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM4AO75164 1064 aa25.78■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 JCADQ9P266 1359 aa25.78■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 PSMA5P28066 241 aa25.78■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 ORAI2Q96SN7 254 aa25.78■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.78■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 SIL1Q9H173 461 aa25.77■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.77■■□□□ 1.72
TMEM200B-201ENST00000420504 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.76■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 FSD1Q9BTV5 496 aa25.76■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.76■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.76■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 TTC6Q86TZ1 520 aa25.75■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.75■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ZMYND15Q9H091 742 aa25.75■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 RPS6KB1P23443 525 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 RNF20Q5VTR2 975 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 DYNC1I1O14576 645 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ELP1O95163 1332 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 AP5Z1O43299 807 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD1Q15327 319 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF790Q6PG37 636 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 KRT85P78386 507 aa25.72■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 GCKRQ14397 625 aa25.72■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 PDCP20941 246 aa25.72■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC39A6Q13433 755 aa25.72■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 FERMT3Q86UX7 667 aa25.72■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.71■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.7■■□□□ 1.71
TMEM200B-201ENST00000420504 ERBB3P21860 1342 aa25.7■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 TAF5LO75529 589 aa25.7■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.7■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.7■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.7■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 COL15A1P39059 1388 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 MYL6BP14649 208 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 COPRSQ9NQ92 184 aa25.69■■□□□ 1.7
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC192P0DO97 292 aa25.68■■□□□ 1.7
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