RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419303.5

PRAMENP-202, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,869 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-202ENST00000419303 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 NBPF14Q5TI25 921 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 NBPF15Q8N660 670 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 LINC00116Q8NCU8 138 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 TRIM27P14373 513 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 LMBRD1Q9NUN5 540 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 BAG6P46379 1132 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC4A2P04920 1241 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 EIF5P55010 431 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 RABEP1Q15276 862 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 LNPKQ9C0E8 428 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 A1BGP04217 495 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 LRSAM1Q6UWE0 723 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 GCC1Q96CN9 775 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 C4BP0C0L5 1744 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 RPS6KA4O75676 772 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 FLIIQ13045 1269 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PROSER3Q2NL68 480 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 AKT1S1Q96B36 256 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ADRA2BP18089 450 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 CDC45O75419 566 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 G2E3Q7L622 706 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ABCC4O15439 1325 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A087WZG4 1122 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ATP10DQ9P241 1426 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ERVV-1B6SEH8 477 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PRDM10Q9NQV6 1147 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 KIF20AO95235 890 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 FGD1P98174 961 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 KSR2Q6VAB6 950 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 NECTIN2Q92692 538 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ADCY9O60503 1353 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 MBD3O95983 291 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ILDR2Q71H61 639 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 COPS6Q7L5N1 327 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ARID3AQ99856 593 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 COL15A1P39059 1388 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 NUP188Q5SRE5 1749 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 ANXA1P04083 346 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 FLAD1Q8NFF5 587 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAMENP-202ENST00000419303 CACNA1FO60840 1977 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 MYL6BP14649 208 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 KCNQ4P56696 695 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 GPT2Q8TD30 523 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 AK7Q96M32 723 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF827Q17R98 1081 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 GNPATO15228 680 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 CAMTA2O94983 1202 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 CLEC4GQ6UXB4 293 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAMENP-202ENST00000419303 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms