RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BCS1LQ9Y276 419 aa13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.19□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.19□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF428Q96B54 188 aa13.19□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CACNA1FO60840 1977 aa13.19□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NTSR2O95665 410 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUSD4Q5VX71 490 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLBD2Q8NHP8 589 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BRIP1Q9BX63 1249 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 STK31Q9BXU1 1019 aa13.18□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GRIN3BO60391 1043 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDE6BP35913 854 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERFEQ4G0M1 354 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NYXQ9GZU5 481 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PIM2Q9P1W9 311 aa13.17□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLX4Q8IY92 1834 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H0YIN7 160 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VAMP4O75379 141 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TCIRG1Q13488 830 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PARP10Q53GL7 1025 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 G2E3Q7L622 706 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NLRP10Q86W26 655 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.16□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 E9PSI1 815 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 YY1P25490 414 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADCY9O60503 1353 aa13.15□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SRGNP10124 158 aa13.14□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLFN5Q08AF3 891 aa13.14□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.14□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYD88Q99836 296 aa13.14□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FLIIQ13045 1269 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TTLL6Q8N841 843 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ISCA1Q9BUE6 129 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TIAM2Q8IVF5 1701 aa13.13□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 STYK1Q6J9G0 422 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SYNE4Q8N205 404 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MASTLQ96GX5 879 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SBF1O95248 1867 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RNF123Q5XPI4 1314 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SH3TC1Q8TE82 1336 aa13.12□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TAF1P21675 1872 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PI4KAP2A4QPH2 592 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NPR1P16066 1061 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RASSF7Q02833 373 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KSR2Q6VAB6 950 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa13.11□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRY2Q49AN0 593 aa13.1□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CNKSR1Q969H4 720 aa13.1□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYH3P11055 1940 aa13.09□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL4A1P02462 1669 aa13.09□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C21orf2O43822 256 aa13.09□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM89AQ96GI7 184 aa13.09□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.09□□□□□ -0.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV5-2P06315 115 aa13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC51AQ86UW1 340 aa13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.08□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPEF2Q9C093 1822 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 F6X3S4 739 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NFKBIEO00221 500 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC10A5Q5PT55 438 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 OLFM4Q6UX06 510 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NLRP3Q96P20 1036 aa13.07□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCC4O15439 1325 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms