RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.36■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNJ4P48050 445 aa22.36■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 MTX1Q13505 466 aa22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 AACSQ86V21 672 aa22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 EVI5LQ96CN4 794 aa22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 DACT1Q9NYF0 836 aa22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 DIP2AQ14689 1571 aa22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 DMTNQ08495 405 aa22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 LRMPQ12912 555 aa22.35■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC27A2O14975 620 aa22.34■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP4K1Q92918 833 aa22.34■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 CBX8Q9HC52 389 aa22.34■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.34■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.34■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.33■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.33■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.33■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 ELP1O95163 1332 aa22.33■■□□□ 1.17
NEFHP1-201ENST00000412845 TNMDQ9H2S6 317 aa22.33■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 ABTB2Q8N961 1025 aa22.32■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 GPATCH3Q96I76 525 aa22.32■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A0D9SFI3 127 aa22.32■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.32■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.32■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 PROSER3Q2NL68 480 aa22.31■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD7Q92527 254 aa22.31■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 STK3Q13188 491 aa22.31■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 SASH1O94885 1247 aa22.3■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 SPATA32Q96LK8 384 aa22.3■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 HOXB7P09629 217 aa22.3■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 NBPF4Q96M43 638 aa22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 DRC7Q8IY82 874 aa22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 NR1I2O75469 434 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 PSMA5P28066 241 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 C14orf37Q86TY3 774 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 TRIM5Q9C035 493 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 BTBD11A6QL63 1104 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 PDCP20941 246 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 PGBD1Q96JS3 809 aa22.28■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 RPS6KB1P23443 525 aa22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF75DP51815 510 aa22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 KAZALD1Q96I82 304 aa22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.27■■□□□ 1.16
NEFHP1-201ENST00000412845 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.27■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SUCLG2Q96I99 432 aa22.27■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TEFQ10587 303 aa22.26■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.26■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.26■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 JAK2O60674 1132 aa22.26■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 FSD1Q9BTV5 496 aa22.26■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 LTN1O94822 1766 aa22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ALDH1L1O75891 902 aa22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SIL1Q9H173 461 aa22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SNRKQ9NRH2 765 aa22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 KSR2Q6VAB6 950 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 HIP1O00291 1037 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF165P49910 485 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD1Q15327 319 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 BICD2Q8TD16 824 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX11Q96FC9 970 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MED23Q9ULK4 1368 aa22.24■■□□□ 1.15
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