RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411326.1

RNU6-575P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 575, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-575P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-575P-201ENST00000411326 SOBPA7XYQ1 873 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 H7C1W4 665 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 OPLAHO14841 1288 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 TREHO43280 583 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 GJD3Q8N144 294 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 FAM129BQ96TA1 746 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 INPP5BP32019 993 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 PTSQ03393 145 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 KLRG1Q96E93 195 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 BRD7Q9NPI1 651 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 DACH1Q9UI36 760 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 USP20Q9Y2K6 914 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 GPR182O15218 404 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-575P-201ENST00000411326 A6NHS1 94 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 ITGAEP38570 1179 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TYRO3Q06418 890 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 XYLBO75191 536 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 DSC3Q14574 896 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 Q6ZNB5 142 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 MRS2Q9HD23 443 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 SLC35F4A4IF30 521 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 UNCXA6NJT0 531 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PNMA5Q96PV4 448 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 CSRNP1Q96S65 589 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 ELP3Q9H9T3 547 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PHACTR2O75167 634 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TRIM47Q96LD4 638 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TNFRSF21O75509 655 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PSMD2Q13200 908 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 ORC1Q13415 861 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 XKR5Q6UX68 686 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 NLRP13Q86W25 1043 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 GMCL1Q96IK5 515 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PHF24Q9UPV7 400 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 IGHA2P01877 340 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 FAM157BP0CG42 384 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 CCINQ13939 588 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 DBN1Q16643 649 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PMEPA1Q969W9 287 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 MARK1Q9P0L2 795 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 PARP2Q9UGN5 583 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-575P-201ENST00000411326 CDC14CA4D256 554 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 SASH3O75995 380 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 ITGA6P23229 1130 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 NEUROD1Q13562 356 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 LAMC2Q13753 1193 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 SORBS3O60504 671 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-575P-201ENST00000411326 EGFRP00533 1210 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms