RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 TTLL6Q8N841 843 aa26.59■■□□□ 1.85
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C4orf48-201ENST00000409248 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 YY1P25490 414 aa26.58■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 STYK1Q6J9G0 422 aa26.58■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
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C4orf48-201ENST00000409248 SLC4A2P04920 1241 aa26.57■■□□□ 1.84
C4orf48-201ENST00000409248 SRGNP10124 158 aa26.57■■□□□ 1.84
C4orf48-201ENST00000409248 ERFEQ4G0M1 354 aa26.57■■□□□ 1.84
C4orf48-201ENST00000409248 MASTLQ96GX5 879 aa26.57■■□□□ 1.84
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C4orf48-201ENST00000409248 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
C4orf48-201ENST00000409248 CNKSR1Q969H4 720 aa26.56■■□□□ 1.84
C4orf48-201ENST00000409248 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.56■■□□□ 1.84
C4orf48-201ENST00000409248 NPR1P16066 1061 aa26.55■■□□□ 1.84
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C4orf48-201ENST00000409248 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.54■■□□□ 1.84
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C4orf48-201ENST00000409248 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.52■■□□□ 1.84
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C4orf48-201ENST00000409248 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.52■■□□□ 1.84
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C4orf48-201ENST00000409248 G2E3Q7L622 706 aa26.51■■□□□ 1.83
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C4orf48-201ENST00000409248 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.5■■□□□ 1.83
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C4orf48-201ENST00000409248 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.5■■□□□ 1.83
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C4orf48-201ENST00000409248 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
C4orf48-201ENST00000409248 NLRP3Q96P20 1036 aa26.49■■□□□ 1.83
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.48■■□□□ 1.83
C4orf48-201ENST00000409248 ALDH1B1P30837 517 aa26.47■■□□□ 1.83
C4orf48-201ENST00000409248 SOGA3Q5TF21 947 aa26.47■■□□□ 1.83
C4orf48-201ENST00000409248 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
C4orf48-201ENST00000409248 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.44■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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C4orf48-201ENST00000409248 FAM89AQ96GI7 184 aa26.44■■□□□ 1.82
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C4orf48-201ENST00000409248 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.42■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 SBF1O95248 1867 aa26.41■■□□□ 1.82
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C4orf48-201ENST00000409248 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 IGKV5-2P06315 115 aa26.4■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC93Q567U6 631 aa26.4■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.39■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.39■■□□□ 1.82
C4orf48-201ENST00000409248 RASSF7Q02833 373 aa26.38■■□□□ 1.81
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C4orf48-201ENST00000409248 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.38■■□□□ 1.81
C4orf48-201ENST00000409248 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.38■■□□□ 1.81
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C4orf48-201ENST00000409248 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.37■■□□□ 1.81
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C4orf48-201ENST00000409248 MYH3P11055 1940 aa26.36■■□□□ 1.81
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C4orf48-201ENST00000409248 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
C4orf48-201ENST00000409248 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.35■■□□□ 1.81
C4orf48-201ENST00000409248 GCKRQ14397 625 aa26.34■■□□□ 1.81
C4orf48-201ENST00000409248 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.34■■□□□ 1.81
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C4orf48-201ENST00000409248 PDE8AO60658 829 aa26.33■■□□□ 1.81
C4orf48-201ENST00000409248 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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