RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTPRN2-204ENST00000404321 NFKBIEO00221 500 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 GOLGA2Q08379 1002 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 SYNE4Q8N205 404 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 PRELPP51888 382 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 CRY2Q49AN0 593 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 OLFM4Q6UX06 510 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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PTPRN2-204ENST00000404321 STK31Q9BXU1 1019 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPRN2-204ENST00000404321 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 SLX4Q8IY92 1834 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 CCER2I3L3R5 266 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 NLRP3Q96P20 1036 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 MYD88Q99836 296 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC4A2P04920 1241 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 ALDH1B1P30837 517 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 G2E3Q7L622 706 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM89AQ96GI7 184 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.36■■□□□ 1.33
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PTPRN2-204ENST00000404321 SLC51AQ86UW1 340 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 VAMP4O75379 141 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF521Q96K83 1311 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRN2-204ENST00000404321 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 CACNA1SQ13698 1873 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 KSR2Q6VAB6 950 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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PTPRN2-204ENST00000404321 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 C1QTNF8P60827 252 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCC4O15439 1325 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF3CO14782 793 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 FLIIQ13045 1269 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRN2-204ENST00000404321 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.27■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 SBF1O95248 1867 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 IGKV5-2P06315 115 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 RRAGCQ9HB90 399 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 GLTPD2A6NH11 291 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 E9PSI1 815 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRN2-204ENST00000404321 GRAPQ13588 217 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRN2-204ENST00000404321 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRN2-204ENST00000404321 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 BBOX1O75936 387 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 SLFN5Q08AF3 891 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-204ENST00000404321 F6X3S4 739 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2-204ENST00000404321 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2-204ENST00000404321 PSMD1Q99460 953 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRN2-204ENST00000404321 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.2■■□□□ 1.3
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