RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.57□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 FAM227BQ96M60 508 aa7.57□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.57□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 COL15A1P39059 1388 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TSPY26PQ9H489 355 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 MTMR6Q9Y217 621 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ME3Q16798 604 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 PHKG2P15735 406 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 SLC39A6Q13433 755 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 GPATCH3Q96I76 525 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TJP1Q07157 1748 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.56□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 A0A0D9SFI3 127 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 HSPA2P54652 639 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 GCKRQ14397 625 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 SLC27A2O14975 620 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 GJB2P29033 226 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 RNF214Q8ND24 703 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.55□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 DTNBO60941 627 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 UBE2HP62256 183 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.23e-8■■■■□ 23.7
SOS1-201ENST00000395038 HIP1O00291 1037 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 MCM5P33992 734 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 COPRSQ9NQ92 184 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 PAPPAQ13219 1627 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CASP7P55210 303 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 KLHL34Q8N239 644 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 LAMA4Q16363 1823 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 PHF14O94880 888 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 COPS6Q7L5N1 327 aa7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TPM2P07951 284 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TERF1P54274 439 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 UVSSAQ2YD98 709 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 SIL1Q9H173 461 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 CYP27B1O15528 508 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 MYL6BP14649 208 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 NECAB1Q8N987 351 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 MYD88Q99836 296 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 USP16Q9Y5T5 823 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TMEM94Q12767 1356 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 TAF5LO75529 589 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 FBXO41Q8TF61 875 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.53□□□□□ -1.2
SOS1-201ENST00000395038 ATP5JP18859 108 aa7.52□□□□□ -1.21
SOS1-201ENST00000395038 RPS6KB1P23443 525 aa7.52□□□□□ -1.21
SOS1-201ENST00000395038 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SOS1-201ENST00000395038 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms