RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.17■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.17■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CRY2Q49AN0 593 aa26.16■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRP10Q86W26 655 aa26.16■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPYL6Q8N831 410 aa26.16■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 IL16Q14005 1332 aa26.15■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SOGA3Q5TF21 947 aa26.15■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.14■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH1B1P30837 517 aa26.14■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.14■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.13■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.12■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF3CO14782 793 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC93Q567U6 631 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR63Q8IWG1 891 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF428Q96B54 188 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRP3Q96P20 1036 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMB2P55268 1798 aa26.1■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA2Q08379 1002 aa26.1■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 OLFM4Q6UX06 510 aa26.1■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.1■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNE4Q8N205 404 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.09■■□□□ 1.77
ANKRD39-201ENST00000393537 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.07■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 STK31Q9BXU1 1019 aa26.06■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.05■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM89AQ96GI7 184 aa26.03■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 MYD88Q99836 296 aa26.03■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 GLTPD2A6NH11 291 aa26.02■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 RRAGCQ9HB90 399 aa26.02■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCC4O15439 1325 aa26.01■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.01■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 SNED1Q8TER0 1413 aa26.01■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC51AQ86UW1 340 aa26■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC4A2P04920 1241 aa25.99■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.99■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF1P21675 1872 aa25.99■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 VAMP4O75379 141 aa25.98■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 TOMM70O94826 608 aa25.98■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.98■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 KSR2Q6VAB6 950 aa25.98■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 G2E3Q7L622 706 aa25.98■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNA1FO60840 1977 aa25.98■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.97■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.97■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMD1Q99460 953 aa25.97■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.96■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.96■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF521Q96K83 1311 aa25.95■■□□□ 1.75
ANKRD39-201ENST00000393537 BBOX1O75936 387 aa25.95■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.95■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR90Q96KV7 1748 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 GRAPQ13588 217 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 CCER2I3L3R5 266 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 FLIIQ13045 1269 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ANKRD39-201ENST00000393537 IGKV5-2P06315 115 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms