RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369123.3

LIN28B-AS1-201, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIN28B-AS1, Length 575 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FAM177BA6PVY3 158 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ERFEQ4G0M1 354 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NLRP3Q96P20 1036 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.91■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.91■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.91■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.9■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.89■■□□□ 1.1
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 VAMP4O75379 141 aa21.89■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.89■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.89■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.89■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ABCC12Q96J65 1359 aa21.88■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LMNB1P20700 586 aa21.88■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 C21orf2O43822 256 aa21.87■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.87■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SBF1O95248 1867 aa21.87■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SLX4Q8IY92 1834 aa21.86■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CCDC93Q567U6 631 aa21.86■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KSR2Q6VAB6 950 aa21.86■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.86■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.86■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.85■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 E9PSI1 815 aa21.85■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SLC4A2P04920 1241 aa21.85■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.85■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NFKBIEO00221 500 aa21.84■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RNF181Q9P0P0 153 aa21.84■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.83■■□□□ 1.09
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.82■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ZNF428Q96B54 188 aa21.82■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.81■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.81■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 BBOX1O75936 387 aa21.81■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TMC4Q7Z404 712 aa21.81■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.81■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FLIIQ13045 1269 aa21.8■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MYD88Q99836 296 aa21.8■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.8■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RASSF7Q02833 373 aa21.79■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SLFN5Q08AF3 891 aa21.79■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PSMD1Q99460 953 aa21.79■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CACNA1SQ13698 1873 aa21.79■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.79■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FAM89AQ96GI7 184 aa21.78■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 VPS33BQ9H267 617 aa21.77■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.77■■□□□ 1.08
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.77■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRELPP51888 382 aa21.76■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.76■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 G2E3Q7L622 706 aa21.76■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.76■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SNED1Q8TER0 1413 aa21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GRAPQ13588 217 aa21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SP8Q8IXZ3 490 aa21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SYNE4Q8N205 404 aa21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ABCC4O15439 1325 aa21.75■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GLTPD2A6NH11 291 aa21.74■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 IGKV5-2P06315 115 aa21.74■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MIER1Q8N108 512 aa21.74■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LINS1Q8NG48 757 aa21.74■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LAMB2P55268 1798 aa21.74■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.73■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PDE8AO60658 829 aa21.73■■□□□ 1.07
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms