RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 C21orf2O43822 256 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 RASSF7Q02833 373 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 NLRP10Q86W26 655 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 MYH3P11055 1940 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 CRY2Q49AN0 593 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.83■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 CCER2I3L3R5 266 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 NFKBIEO00221 500 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF181Q9P0P0 153 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 GOLGA2Q08379 1002 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 ALDH1B1P30837 517 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 PRELPP51888 382 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 LMNB1P20700 586 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 SOGA3Q5TF21 947 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 STK31Q9BXU1 1019 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF521Q96K83 1311 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 SYNE4Q8N205 404 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 NLRP3Q96P20 1036 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF428Q96B54 188 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 VAMP4O75379 141 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC93Q567U6 631 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC4A2P04920 1241 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 MYD88Q99836 296 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 OLFM4Q6UX06 510 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 G2E3Q7L622 706 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 KSR2Q6VAB6 950 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM89AQ96GI7 184 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 SNED1Q8TER0 1413 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 SPEF2Q9C093 1822 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BP5-201ENST00000366391 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 ABCC4O15439 1325 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 C1QTNF8P60827 252 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 FLIIQ13045 1269 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 WDR90Q96KV7 1748 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 KIF3CO14782 793 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 COL4A1P02462 1669 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 IGKV5-2P06315 115 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC51AQ86UW1 340 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 MIER1Q8N108 512 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 SCN4AP35499 1836 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP5-201ENST00000366391 E9PSI1 815 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 PSMD1Q99460 953 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 GLTPD2A6NH11 291 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 BBOX1O75936 387 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SLFN5Q08AF3 891 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5-201ENST00000366391 GRAPQ13588 217 aa23.63■■□□□ 1.37
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