RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 MYO1BO43795 1136 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ERLIN1O75477 346 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 IL15P40933 162 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TAF4BQ92750 862 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 FLT4P35916 1363 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CTAGE5O15320 804 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CETN2P41208 172 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TTC22Q5TAA0 569 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CNNM3Q8NE01 707 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 GSTO1P78417 241 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 UBA7P41226 1012 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 H0YHG0 523 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 MCM5P33992 734 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 IQCEQ6IPM2 695 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TBX22Q9Y458 520 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 IDEP14735 1019 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 VPS36Q86VN1 386 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 OGFOD1Q8N543 542 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CYP7A1P22680 504 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 FSIP1Q8NA03 581 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 IL27Q8NEV9 243 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 STX6O43752 255 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SPA17Q15506 151 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ATP8B2P98198 1209 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TMTC2Q8N394 836 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CALML4Q96GE6 196 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 IGHDP01880 384 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 BRF1Q92994 677 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SIRT1Q96EB6 747 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 DCAF5Q96JK2 942 aa11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 GJB2P29033 226 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 PDE1AP54750 535 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NEBLO76041 1014 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SSFA2P28290 1259 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 AMPD3Q01432 767 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 WTAPQ15007 396 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ESR2Q92731 530 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ESPNB1AK53 854 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TRAF1Q13077 416 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SDSP20132 328 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 EYA1Q99502 592 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 KRT23Q9C075 422 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NUCB1Q02818 461 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CETN1Q12798 172 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NYXQ9GZU5 481 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 NPATQ14207 1427 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 ZBTB43O43298 467 aa11.9□□□□□ -0.5
ZNF548-202ENST00000366197 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms