RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364056.1

RNU6-960P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 960, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-960P, Length 120 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-960P-201ENST00000364056 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 ARSDP51689 593 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 C8orf34Q49A92 452 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 IER5Q5VY09 327 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 RGS22Q8NE09 1264 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMC1Q8TDI8 760 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 BRD7Q9NPI1 651 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 NDUFB5O43674 189 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 CTBSQ01459 385 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 SV2AQ7L0J3 742 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMC7Q7Z402 723 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 EFSO43281 561 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 CD33P20138 364 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 SASH3O75995 380 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 IGHA2P01877 340 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM157BP0CG42 384 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLC30A3Q99726 388 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 GSX2Q9BZM3 304 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 C2CD2LO14523 706 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 XYLBO75191 536 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 PLCB3Q01970 1234 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 GJD3Q8N144 294 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 GMCL1Q96IK5 515 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 ASB16Q96NS5 453 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 MARK1Q9P0L2 795 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 H3BM21 787 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 GPR182O15218 404 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 PCSK2P16519 638 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 FGFR3P22607 806 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNQ4P56696 695 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TTC16Q8NEE8 873 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF428Q96B54 188 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 CITED4Q96RK1 184 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM129BQ96TA1 746 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-960P-201ENST00000364056 ERBB4Q15303 1308 aa5.65□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 EPB42P16452 691 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 CCINQ13939 588 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 GAS6Q14393 721 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 DSC3Q14574 896 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 SETDB2Q96T68 719 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 ELP3Q9H9T3 547 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM63CQ9P1W3 806 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 CNTN3Q9P232 1028 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZFATQ9P243 1243 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 TREHO43280 583 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 EGFRP00533 1210 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 USP5P45974 858 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 EHHADHQ08426 723 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPEM2Q0P670 501 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 PDE3BQ13370 1112 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 ORC1Q13415 861 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 LAMC2Q13753 1193 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 XKR5Q6UX68 686 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 BHMTQ93088 406 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 PHF24Q9UPV7 400 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 TNFRSF21O75509 655 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU6-960P-201ENST00000364056 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms