RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 MED23Q9ULK4 1368 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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HOXD1-201ENST00000331462 ME3Q16798 604 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 C5P01031 1676 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC6O95255 1503 aa26.95■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 FIBPO43427 364 aa26.95■■□□□ 1.91
HOXD1-201ENST00000331462 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV5-2P06315 115 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 FAM227BQ96M60 508 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 KIF1AQ12756 1690 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 SLC27A2O14975 620 aa26.94■■□□□ 1.9
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HOXD1-201ENST00000331462 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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HOXD1-201ENST00000331462 RNF20Q5VTR2 975 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.93■■□□□ 1.9
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HOXD1-201ENST00000331462 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 COL15A1P39059 1388 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 ORAI2Q96SN7 254 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 ERBB3P21860 1342 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0D9SFI3 127 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.91■■□□□ 1.9
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HOXD1-201ENST00000331462 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 ELP1O95163 1332 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 PDCP20941 246 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF790Q6PG37 636 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 USP25Q9UHP3 1055 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 KCNJ4P48050 445 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD1-201ENST00000331462 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.89■■□□□ 1.89
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HOXD1-201ENST00000331462 FSD1Q9BTV5 496 aa26.89■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.88■■□□□ 1.89
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HOXD1-201ENST00000331462 RGPD5Q99666 1765 aa26.88■■□□□ 1.89
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HOXD1-201ENST00000331462 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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HOXD1-201ENST00000331462 ADCY5O95622 1261 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.87■■□□□ 1.89
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HOXD1-201ENST00000331462 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 KRT85P78386 507 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 UQCRHP07919 91 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 ATP5JP18859 108 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 DYNC1I1O14576 645 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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HOXD1-201ENST00000331462 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 SIL1Q9H173 461 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD1-201ENST00000331462 TAF5LO75529 589 aa26.82■■□□□ 1.88
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HOXD1-201ENST00000331462 KRT32Q14532 448 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 TTC6Q86TZ1 520 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 PHKG2P15735 406 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 MAP7D2Q96T17 732 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC192P0DO97 292 aa26.8■■□□□ 1.88
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