RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP98P52948 1817 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCORQ6W2J9 1755 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC15A2Q16348 729 aa34.32■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL2L12Q9HB09 334 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.31■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 BICDL1Q6ZP65 573 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SETDB2Q96T68 719 aa34.3■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4AP0C0L4 1744 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP85Q6P2H3 762 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.29■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D9BQ66K14 1250 aa34.28■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUCLG2Q96I99 432 aa34.28■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-201ENST00000318988 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM177BA6PVY3 158 aa34.26■■■■□ 3.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM89AQ96GI7 184 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 GYS1P13807 737 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASP7P55210 303 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP8B2P98198 1209 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHDP01880 384 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 NYXQ9GZU5 481 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDHR2Q9BYE9 1310 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIRT2Q8IXJ6 389 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLGN1Q8N2Q7 840 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 KAZALD1Q96I82 304 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPHP1O15259 732 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTSR2O95665 410 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFIXQ14938 502 aa34.19■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MTX1Q13505 466 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.16■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNE4Q8N205 404 aa34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G12BQ9BX93 195 aa34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHMP3Q9Y3E7 222 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE8AO60658 829 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXO4P98177 505 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NUTM1Q86Y26 1132 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSH3Q8TE77 659 aa34.13■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TM4SF1P30408 202 aa34.12■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 QSER1Q2KHR3 1735 aa34.11■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ERFEQ4G0M1 354 aa34.1■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DCTPP1Q9H773 170 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL24A1Q17RW2 1714 aa34.08■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC57Q2TAC2 916 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTLL11Q8NHH1 800 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDR1Q08345 913 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC16A10Q8TF71 515 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP10P09238 476 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC152Q4G0S7 254 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
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