RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.18■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 USP16Q9Y5T5 823 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 TCHHQ07283 1943 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 SIL1Q9H173 461 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.17■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 F13A1P00488 732 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 UTYO14607 1347 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP27B1O15528 508 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.16■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 FIBPO43427 364 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 SASH1O94885 1247 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 EVI5LQ96CN4 794 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 GJB2P29033 226 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 VPS53Q5VIR6 699 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 MYD88Q99836 296 aa25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.14■■□□□ 1.62
PTDSS2-201ENST00000308020 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.14■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 MCM5P33992 734 aa25.14■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 UBE2HP62256 183 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 DCAF5Q96JK2 942 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM227BQ96M60 508 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 NECTIN1Q15223 517 aa25.13■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 C5P01031 1676 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 GCKRQ14397 625 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNJ4P48050 445 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNB2Q92953 911 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 ME3Q16798 604 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 NECAB1Q8N987 351 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 MTMR6Q9Y217 621 aa25.11■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 ST3GAL1Q11201 340 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 CABP4P57796 275 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 MPNDQ8N594 471 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 COL18A1P39060 1754 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 HSPA2P54652 639 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 USP25Q9UHP3 1055 aa25.09■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.08■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.08■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 DCCP43146 1447 aa25.08■■□□□ 1.61
PTDSS2-201ENST00000308020 MAP4K1Q92918 833 aa25.07■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.07■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 TERF1P54274 439 aa25.07■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.07■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 UVSSAQ2YD98 709 aa25.06■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 A0A0D9SFI3 127 aa25.06■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.06■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.06■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC27A2O14975 620 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 FSD1Q9BTV5 496 aa25.05■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 HIP1O00291 1037 aa25.04■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.04■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.04■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.03■■□□□ 1.6
PTDSS2-201ENST00000308020 ADCY5O95622 1261 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms