RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 ERFEQ4G0M1 354 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 CEP350Q5VT06 3117 aa23.44■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 SLX4Q8IY92 1834 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 LMNB1P20700 586 aa23.43■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 PARP10Q53GL7 1025 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 CRY2Q49AN0 593 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.42■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.41■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 KIF3CO14782 793 aa23.41■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.41■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.4■■□□□ 1.34
PTX4-201ENST00000293922 TCIRG1Q13488 830 aa23.39■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.39■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 HYPKQ9NX55 129 aa23.39■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 CACNA1SQ13698 1873 aa23.39■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.39■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.38■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 SOGA3Q5TF21 947 aa23.38■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 NLRP10Q86W26 655 aa23.38■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 TSPYL6Q8N831 410 aa23.38■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.37■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.37■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.37■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.36■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 VAMP4O75379 141 aa23.36■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 ALDH1B1P30837 517 aa23.36■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.36■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 ZNF428Q96B54 188 aa23.36■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.36■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.35■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 OLFM4Q6UX06 510 aa23.35■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.35■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 CCDC93Q567U6 631 aa23.34■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.34■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.33■■□□□ 1.33
PTX4-201ENST00000293922 SYNE4Q8N205 404 aa23.33■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.33■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.32■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 NLRP3Q96P20 1036 aa23.32■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.32■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 SNED1Q8TER0 1413 aa23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 GLTPD2A6NH11 291 aa23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.3■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.29■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.29■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.29■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 RRAGCQ9HB90 399 aa23.28■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 TOMM70O94826 608 aa23.27■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.27■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 SLC51AQ86UW1 340 aa23.27■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTX4-201ENST00000293922 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.26■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 ABCC4O15439 1325 aa23.25■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.25■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 FAM89AQ96GI7 184 aa23.25■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 LAMB2P55268 1798 aa23.24■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 BCAR3O75815 825 aa23.24■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.24■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 PSMD1Q99460 953 aa23.24■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.23■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 MYD88Q99836 296 aa23.22■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.22■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 STK31Q9BXU1 1019 aa23.22■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 POTECB2RU33 542 aa23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 HSPA6P17066 643 aa23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTX4-201ENST00000293922 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms