RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 PTH1RQ03431 593 aa20.38■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 RASEFQ8IZ41 740 aa20.38■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 EXOC5O00471 708 aa20.37■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 EVI5LQ96CN4 794 aa20.37■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.37■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.37■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.37■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 IL27Q8NEV9 243 aa20.36■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 FAM89AQ96GI7 184 aa20.36■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 FAM177BA6PVY3 158 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 TIMM10P62072 90 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 CHGBP05060 677 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 HSPA4P34932 840 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 TNNI3KQ59H18 835 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 RAD50Q92878 1312 aa20.35■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 NUCB2P80303 420 aa20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 SYNE4Q8N205 404 aa20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 COPRSQ9NQ92 184 aa20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 ATG3Q9NT62 314 aa20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 STARD3NLO95772 234 aa20.33■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.33■□□□□ 0.85
PKN3-201ENST00000291906 ANAPC15P60006 121 aa20.33■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 LRRC24Q50LG9 513 aa20.33■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 A0A0D9SFI3 127 aa20.32■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.32■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.32■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.32■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 H7C1W4 665 aa20.31■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 FOXO4P98177 505 aa20.31■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.31■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 MRC1P22897 1456 aa20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 CASP7P55210 303 aa20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 ERBB4Q15303 1308 aa20.3■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 MCM2P49736 904 aa20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 GORABQ5T7V8 394 aa20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 AK2P54819 239 aa20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 HLFQ16534 295 aa20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.28■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 TCIRG1Q13488 830 aa20.28■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 SNRKQ9NRH2 765 aa20.28■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 GOLIM4O00461 696 aa20.28■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.27■□□□□ 0.84
PKN3-201ENST00000291906 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 DDB1Q16531 1140 aa20.26■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.26■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.26■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.26■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 ABCC6O95255 1503 aa20.26■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.25■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 HIP1O00291 1037 aa20.25■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.832e-7■■■□□ 15.1
PKN3-201ENST00000291906 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.25■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.25■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.25■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 EYA2O00167 538 aa20.24■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.24■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 ATP5JP18859 108 aa20.24■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.24■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 NECAB1Q8N987 351 aa20.23■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.23■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 A0A1B0GUL7 405 aa20.23■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 RUFY3Q7L099 469 aa20.23■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 LARGE1O95461 756 aa20.22■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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