RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 PTPRCP08575 1304 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 NCAPD2Q15021 1401 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 NECTIN2Q92692 538 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 STRN4Q9NRL3 753 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 RAD50Q92878 1312 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 F6X3S4 739 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 BTG4Q9NY30 223 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 JCADQ9P266 1359 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 CDC45O75419 566 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 CNPY4Q8N129 248 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 CASQ1P31415 396 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 BABAM1Q9NWV8 329 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 LMO7Q8WWI1 1683 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 MEIS3Q99687 375 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 ST18O60284 1047 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 GUCY2CP25092 1073 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 EVA1CP58658 441 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 ST7Q9NRC1 585 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 STK31Q9BXU1 1019 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 ATP10DQ9P241 1426 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 KCNQ3O43525 872 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 BRD1O95696 1058 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 GCC1Q96CN9 775 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 TNNT1P13805 278 aa25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.97■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 FLIIQ13045 1269 aa25.96■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.96■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.95■■□□□ 1.75
PITX1-201ENST00000265340 PRR29P0C7W0 189 aa25.95■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.95■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.94■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 ABCC6O95255 1503 aa25.94■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.94■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 MYO1CO00159 1063 aa25.93■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 CEP85Q6P2H3 762 aa25.93■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 C8orf37Q96NL8 207 aa25.93■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.93■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.93■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 TEFQ10587 303 aa25.92■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 USP26Q9BXU7 913 aa25.92■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.92■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.92■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 BANK1Q8NDB2 785 aa25.92■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.92■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 TEX35Q5T0J7 233 aa25.91■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 TMX1Q9H3N1 280 aa25.91■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 CEP83Q9Y592 693 aa25.91■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 RNF20Q5VTR2 975 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 BTBD11A6QL63 1104 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 AP5Z1O43299 807 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 DCTPP1Q9H773 170 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 LRP6O75581 1613 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 CACNA1FO60840 1977 aa25.89■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 ERO1AQ96HE7 468 aa25.89■■□□□ 1.74
PITX1-201ENST00000265340 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 MX1P20591 662 aa25.89■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 ATG3Q9NT62 314 aa25.89■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 C10orf67Q8IYJ2 551 aa25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 SPC24Q8NBT2 197 aa25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 NGLY1Q96IV0 654 aa25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms