RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 GORABQ5T7V8 394 aa14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.72□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 GOLIM4O00461 696 aa14.72□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.6
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SEH1L-201ENST00000262124 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 SLIT3O75094 1523 aa14.72□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.71□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.71□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.71□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.71□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 SNAP23O00161 211 aa14.71□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.71□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 EXOC5O00471 708 aa14.7□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 AK2P54819 239 aa14.7□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 HLFQ16534 295 aa14.7□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.7□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 FGD1P98174 961 aa14.7□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 LARGE1O95461 756 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 TNNI3KQ59H18 835 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 PI16Q6UXB8 463 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 NCAPD2Q15021 1401 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 FERMT3Q86UX7 667 aa14.69□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 KDM4AO75164 1064 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 CHST3Q7LGC8 479 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 DDIT3P35638 169 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 EVI5LQ96CN4 794 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 EP400Q96L91 3159 aa14.68□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 LRRC37A3O60309 1634 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 HSPA4P34932 840 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 MTX1Q13505 466 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 ATG3Q9NT62 314 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 RAD50Q92878 1312 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 NUCB2P80303 420 aa14.66□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.66□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.66□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.66□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 RNF214Q8ND24 703 aa14.66□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.66□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 A0A0G2JLW4 131 aa14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 WASHC4Q2M389 1173 aa14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 STARD3NLO95772 234 aa14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 ADORA1P30542 326 aa14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 MPNDQ8N594 471 aa14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 HAND2P61296 217 aa14.65□□□□□ -0.06
SEH1L-201ENST00000262124 KCNQ2O43526 872 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 VPS53Q5VIR6 699 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 RUFY3Q7L099 469 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 FIBPO43427 364 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 C8orf37Q96NL8 207 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 A0A1B0GUL7 405 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 FOXO4P98177 505 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.64□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 DDX11Q96FC9 970 aa14.63□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.63□□□□□ -0.07
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.63□□□□□ -0.07
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