RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 CASQ1P31415 396 aa10.45□□□□□ -0.74
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PTPRB-201ENST00000261266 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-201ENST00000261266 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
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PTPRB-201ENST00000261266 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.4□□□□□ -0.74
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