RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 GPTP24298 496 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT17Q9BSW7 474 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 STK31Q9BXU1 1019 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM177BA6PVY3 158 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB2P05120 415 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NLGN2Q8NFZ4 835 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SETDB2Q96T68 719 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF652Q9Y2D9 606 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2L13Q9BXK5 485 aa32.62■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PLBD2Q8NHP8 589 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D2Q9BYX2 928 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SSH1Q8WYL5 1049 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX19BQ9UMR2 479 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 FLIIQ13045 1269 aa32.58■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP4AQ9BY43 222 aa32.58■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa32.57■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.57■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RIC3Q7Z5B4 369 aa32.57■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 WWC3Q9ULE0 1092 aa32.57■■■□□ 2.81
CAPNS1-201ENST00000246533 NRXN2Q9P2S2 1712 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PI4KAP2A4QPH2 592 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP10DQ9P241 1426 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SUSD4Q5VX71 490 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY9O60503 1353 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 RGL2O15211 777 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TCIRG1Q13488 830 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf71Q711Q0 1435 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA1FO60840 1977 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CD2APQ9Y5K6 639 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNE4Q8N205 404 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF13BQ9NQT8 1826 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JLW4 131 aa32.51■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 F6X3S4 739 aa32.51■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KSR2Q6VAB6 950 aa32.51■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CNBD1Q8NA66 436 aa32.51■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MYD88Q99836 296 aa32.51■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TNNQ9UQP3 1299 aa32.51■■■□□ 2.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP10Q86W26 655 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 C22orf23Q9BZE7 217 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP5Q9NZZ3 219 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA5P30532 468 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ISCA1Q9BUE6 129 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SMC4Q9NTJ3 1288 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NPHP1O15259 732 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SMC5Q8IY18 1101 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NTSR2O95665 410 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX58O95786 925 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ERFEQ4G0M1 354 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DPEP1P16444 411 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF16BQ96L93 1317 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PXDNLA1KZ92 1463 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa32.47■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC12Q96J65 1359 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV5-2P06315 115 aa32.46■■■□□ 2.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 MCM4P33991 863 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM27P14373 513 aa32.45■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH1L2Q3SY69 923 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP10Q53GL7 1025 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFB2P61812 414 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ST5P78524 1137 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM89AQ96GI7 184 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf67Q6ZVT6 689 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 FSD2A1L4K1 749 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa32.39■■■□□ 2.78
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