RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 RNF214Q8ND24 703 aa24.87■■□□□ 1.57
STRADB-201ENST00000194530 OFD1O75665 1012 aa24.86■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 GJB2P29033 226 aa24.86■■□□□ 1.57
STRADB-201ENST00000194530 GCKRQ14397 625 aa24.86■■□□□ 1.57
STRADB-201ENST00000194530 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.86■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.85■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 SIL1Q9H173 461 aa24.84■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.83■■□□□ 1.57
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STRADB-201ENST00000194530 SLC27A2O14975 620 aa24.82■■□□□ 1.56
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STRADB-201ENST00000194530 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.82■■□□□ 1.56
STRADB-201ENST00000194530 TPM2P07951 284 aa24.82■■□□□ 1.56
STRADB-201ENST00000194530 ME3Q16798 604 aa24.82■■□□□ 1.56
STRADB-201ENST00000194530 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.82■■□□□ 1.56
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STRADB-201ENST00000194530 USP16Q9Y5T5 823 aa24.77■■□□□ 1.56
STRADB-201ENST00000194530 ABCC6O95255 1503 aa24.77■■□□□ 1.56
STRADB-201ENST00000194530 ATP5JP18859 108 aa24.77■■□□□ 1.56
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STRADB-201ENST00000194530 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.77■■□□□ 1.56
STRADB-201ENST00000194530 TERF1P54274 439 aa24.76■■□□□ 1.55
STRADB-201ENST00000194530 COL15A1P39059 1388 aa24.76■■□□□ 1.55
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STRADB-201ENST00000194530 PDCP20941 246 aa24.75■■□□□ 1.55
STRADB-201ENST00000194530 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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STRADB-201ENST00000194530 MEGF6O75095 1541 aa24.75■■□□□ 1.55
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STRADB-201ENST00000194530 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-201ENST00000194530 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
STRADB-201ENST00000194530 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
STRADB-201ENST00000194530 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.72■■□□□ 1.55
STRADB-201ENST00000194530 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.71■■□□□ 1.55
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