RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSMD1Q99460 953 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC34A2O95436 690 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HLFQ16534 295 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCM10Q7L590 875 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRM1Q13255 1194 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CAPNS2Q96L46 248 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ECE1P42892 770 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SNED1Q8TER0 1413 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CRY2Q49AN0 593 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABCC12Q96J65 1359 aa24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANP32CO43423 234 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPS15P42566 896 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NYXQ9GZU5 481 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NFE2L2Q16236 605 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COL4A5P29400 1685 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCNN1DP51172 638 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DCTN1Q14203 1278 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NGEFQ8N5V2 710 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LTBP1Q14766 1721 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRAF5O00463 557 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-201ENST00000006275 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CST9Q5W186 159 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NIM1KQ8IY84 436 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSKSQ9UJT2 592 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPTP24298 496 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RUNDC1Q96C34 613 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPIP5K2O43314 1243 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC51AQ86UW1 340 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AOC2O75106 756 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAP2K2P36507 400 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIPK4P57078 832 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC184Q52MB2 194 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RGS19P49795 217 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AOC3Q16853 763 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SUSD4Q5VX71 490 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CFAP44Q96MT7 982 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CA12O43570 354 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYL6BP14649 208 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NEUROD2Q15784 382 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRS2Q9HD23 443 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NUP98P52948 1817 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NTSR2O95665 410 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CXCL9Q07325 125 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VPS33BQ9H267 617 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.71■■□□□ 1.55
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