RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002084.13

Abcd1-201, Transcript of ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Abcd1, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Dydc1Q9D9T0 175 aa14.95□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa14.95□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Rnf123Q5XPI3 1314 aa14.95□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Cd22P35329 862 aa14.95□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Emilin2Q8K482 1074 aa14.95□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 NinlQ6ZQ12 1394 aa14.95□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ankrd35E9Q9D8 996 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Q9D2X8 372 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ankrd44B2RXR6 993 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 CalrP14211 416 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Letm1Q9Z2I0 738 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Frat2Q8K025 231 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Myo3aQ8K3H5 1613 aa14.94□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ccdc83Q9D4V3 305 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ankrd50F7BE84 1390 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Q3UPC7 1272 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Coro7Q9D2V7 922 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 CenpjQ569L8 1344 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Kif13aQ9EQW7 1749 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Mcm2P97310 904 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Cct8l1Q80YT3 562 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa14.93□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Babam1Q3UI43 333 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Cep63Q3UPP8 700 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Efcab8Q8C9R9 203 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 4930550L24RikQ99PA7 320 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Slc5a4aQ9ET37 656 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 InsrP15208 1372 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Gsto1O09131 240 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Kcna6Q61923 529 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Q8CEZ4 452 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Cep89Q9CZX2 791 aa14.92□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Map2k1P31938 393 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Zmym1Q3TJB1 983 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Stx6Q9JKK1 255 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Gm42641I6L9G2 585 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 AtripQ8BMG1 785 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Dnaaf4Q8R368 420 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Cabp4Q8VHC5 271 aa14.91□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Nsd3Q6P2L6 1439 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Tsen34Q8BMZ5 316 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Sh2b1Q91ZM2 756 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Txnrd1Q9JMH6 613 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Anks1aP59672 1150 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Iqgap3F8VQ29 1632 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Klra5Q60652 266 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Klra3Q64329 266 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 KinQ8K339 391 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 ChmQ9QXG2 665 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Stk11Q9WTK7 436 aa14.9□□□□□ -0.02
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ccdc40Q8BI79 1192 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Kifc2O08672 792 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Mcm5P49718 733 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Kcnd1Q03719 651 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Uri1Q3TLD5 531 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Vps18Q8R307 973 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Gm21698A0A087WQP8 267 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Znf568E9PYI1 671 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Gm21671G3UY31 267 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 CalcaP70160 136 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Klra9Q2TJJ8 266 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Klra10Q9R1G6 266 aa14.89□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Tulp4Q9JIL5 1547 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Strn4P58404 760 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Tsen2Q6P7W5 460 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Tmco3Q8BH01 678 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ccdc7Q9D541 371 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Panx2Q6IMP4 677 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 TnmdQ9EP64 317 aa14.88□□□□□ -0.03
Abcd1-201ENSMUST00000002084 Ctnna3Q65CL1 895 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.1 ms