RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641321.1

CASC19-222, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,173 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-222	ENST00000641321	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NDUFS8	O00217	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SPRY2	O43597	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	VPS26A	O75436	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NDST3	O95803	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MMP2	P08253	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	UGT1A6	P19224	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PTPN3	P26045	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CPA2	P48052	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PRIM2	P49643	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	DIO1	P49895	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PLTP	P55058	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MTTP	P55157	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CASP9	P55211	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MLF1	P58340	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GMFB	P60983	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FMO1	Q01740	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GALNT2	Q10471	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FOXO1	Q12778	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PNOC	Q13519	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	DOC2A	Q14183	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	AMER3	Q8N944	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	COQ7	Q99807	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MED12	Q93074	2177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321		A0A0J9YVX5	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321		H0YIG0	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PEX11A	O75192	247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	TSPAN9	O75954	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	EPPIN	O95925	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	PNP	P00491	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-222	ENST00000641321	HPGD	P15428	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms