RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 HHATLQ9HCP6 504 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 MYNNQ9NPC7 610 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 GLRX2Q9NS18 164 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 NTMQ9P121 344 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 ALG1L2C9J202 215 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 H3BML4 177 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 OVOL3O00110 214 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 SEC14L5O43304 696 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 CRLF1O75462 422 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 IGKV1D-16P01601 117 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 GCAP28676 217 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 ECHS1P30084 290 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 KCNJ5P48544 419 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 PRKAA2P54646 552 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 NR1H2P55055 460 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 LCP2Q13094 533 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 C8orf74Q6P047 294 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 FAM110BQ8TC76 370 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 Q9N2J8 555 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 USF3Q68DE3 2245 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN3-255ENST00000637100 RTTNQ86VV8 2226 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 A0A087WZY1 265 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 HS3ST1O14792 307 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 NKX2-2O95096 273 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 ANGPTL1O95841 491 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 PLAUP00749 431 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 TAC1P20366 129 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 HMOX2P30519 316 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 PPP2R2BQ00005 443 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 C2orf80Q0P641 193 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 BEND4Q6ZU67 534 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 UTS2O95399 124 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 RAC1P63000 192 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 TMEM107Q6UX40 140 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 OR10D3Q8NH80 312 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 SENP1Q9P0U3 644 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 STOML1Q9UBI4 398 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 TIMM22Q9Y584 194 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 CCDC151A5D8V7 595 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 TBX19O60806 448 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 DANCRP0C864 163 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 LCN1P31025 176 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 STX5Q13190 355 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 TNK1Q13470 666 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 KIAA0040Q15053 153 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 ETFDHQ16134 617 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 SGCBQ16585 318 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 CPTPQ5TA50 214 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 OR4C3Q8NH37 302 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 KCNA7Q96RP8 456 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 NPAS1Q99742 590 aa14.68□□□□□ -0.06
CLN3-255ENST00000637100 EBPLQ9BY08 206 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms