RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX20	Q7Z614	316 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD3	Q8WU67	409 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MSL2	Q9HCI7	577 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SCD	O00767	359 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RTL8C	O15255	209 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PMM2	O15305	246 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CXCL13	O43927	109 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PEX14	O75381	377 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf105	O95561	183 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	OPN1SW	P03999	348 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV3-11	P04433	115 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	HK1	P19367	917 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ACRV1	P26436	265 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	THBS4	P35443	961 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC6A9	P48067	706 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	LAPTM5	Q13571	262 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RNLS	Q5VYX0	342 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM47B	Q8NA70	645 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	FRZB	Q92765	325 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TIGD1	Q96MW7	591 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TCF12	Q99081	682 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM15	Q9C019	465 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	EXD2	Q9NVH0	621 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	STOML1	Q9UBI4	398 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNAP23-223	ENST00000627440	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2M5	A3KFT3	312 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BMM5	538 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TGDS	O95455	350 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPIND1	P05546	499 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	UQCRC2	P22695	453 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB8A	P61006	207 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	XIAP	P98170	497 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS1	Q08116	209 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SERTAD2	Q14140	314 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	LELP1	Q5T871	98 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	GGN	Q86UU5	652 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR22	Q8IZ63	422 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	LILRA2	Q8N149	483 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NUP37	Q8NFH4	326 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF128	Q8TEB7	428 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF183	Q96D59	192 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NODAL	Q96S42	347 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	WAC	Q9BTA9	647 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD62	A6NC57	917 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440		A8MXK9	166 aa		5.14	□□□□□ -1.59

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