RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 RFX3P48380 749 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PRR5P85299 388 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 SGCBQ16585 318 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GGNQ86UU5 652 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8RI6L899 631 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ANGPTL1O95841 491 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GSTA1P08263 222 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 IFI6P09912 130 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GABRA3P34903 492 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 IMPG1Q17R60 797 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GSX2Q9BZM3 304 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 HEATR5AQ86XA9 2040 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GXYLT2A0PJZ3 443 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM64BA6NI03 449 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 TTC36A6NLP5 189 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 SHISA8B8ZZ34 492 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV1D-16P01601 117 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 THBDP07204 575 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A8P48029 635 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 STOML1Q9UBI4 398 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GMFGO60234 142 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 KCNH1O95259 989 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PYGBP11216 843 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PRIMA1Q86XR5 153 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 OR6K3Q8NGY3 331 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 IGFBPL1Q8WX77 278 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3R3Q92569 461 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC126Q96EE4 140 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EMCNQ9ULC0 261 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EMC9Q9Y3B6 208 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 G3V2L1 256 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 RIPK2O43353 540 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 KLF4O43474 513 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PPP3CBP16298 524 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF17P17021 662 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 IL11P20809 199 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K8P41279 467 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PTH2RP49190 550 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 BEX5Q5H9J7 111 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 MNS1Q8NEH6 495 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EGLN2Q96KS0 407 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PRRG4Q9BZD6 226 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 VDAC3Q9Y277 283 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 USF3Q68DE3 2245 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ALG1L2C9J202 215 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 H3BQF6 201 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PCSK6P29122 969 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0040Q15053 153 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ZYG11AQ6WRX3 759 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 OR10D3Q8NH80 312 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 GPR151Q8TDV0 419 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 MZB1Q8WU39 189 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRG7Q96K78 797 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 EQTNQ9NQ60 294 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC4AQ9UMR7 237 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087WZY1 265 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NKX2-2O95096 273 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PLGP00747 810 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 MYL2P10916 166 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PRPS2P11908 318 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 PAX1P15863 534 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 CTBP2P56545 445 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 NAA20P61599 178 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRF-216ENST00000617451 HSPB3Q12988 150 aa22.32■■□□□ 1.16
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