RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617053.2

PNMA8C-201, Transcript of PNMA family member 8C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8C, Length 4,255 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8C-201ENST00000617053 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 OR8K3Q8NH51 312 aa8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SNX33Q8WV41 574 aa8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PIK3R3Q92569 461 aa8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CD180Q99467 661 aa8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 MGLLQ99685 303 aa8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 DLL1O00548 723 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SNPHO15079 494 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CSTAP01040 98 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CD22P20273 847 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 FCARP24071 287 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 NRG3P56975 720 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 REEP5Q00765 189 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 KIAA0040Q15053 153 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 TAF13Q15543 124 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC15A4Q8N697 577 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 HPS1Q92902 700 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SGPP1Q9BX95 441 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 POT1Q9NUX5 634 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CXCR1P25024 350 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 AHRP35869 848 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 MPLP40238 635 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PPP2R2BQ00005 443 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PLGLB1Q02325 96 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 OTPQ5XKR4 325 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 FAM111BQ6SJ93 734 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 DHRS13Q6UX07 377 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF527Q8NB42 609 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SGCDQ92629 289 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 MAP3K3Q99759 626 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 RARRES3Q9UL19 164 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 COL4A6Q14031 1691 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 A0A0G2JPF8 293 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 FAM183AA6NL82 134 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CCRL2O00421 344 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 YY2O15391 372 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CER1O95813 267 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 OSMP13725 252 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PKLRP30613 574 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 XCR1P46094 333 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP12AP54707 1039 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ZP2Q05996 745 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 COX10Q12887 443 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 NKG7Q16617 165 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 C6orf183Q5T699 404 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 IFT52Q9Y366 437 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PGRMC2O15173 223 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 HCRTR2O43614 444 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 HEXBP07686 556 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 RORCP51449 518 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC14A1Q13336 389 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 GXYLT1Q4G148 440 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 KRT74Q7RTS7 529 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 PJA1Q8NG27 643 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 NR4A3Q92570 626 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 RSC1A1Q92681 617 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 CDS1Q92903 461 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 LRR1Q96L50 414 aa8.66□□□□□ -1.02
PNMA8C-201ENST00000617053 TMED9Q9BVK6 235 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms