RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 ALG1L2C9J202 215 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 TOXO94900 526 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 DPP4P27487 766 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 TIMP3P35625 211 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 RFX3P48380 749 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 HBA1P69905 142 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 AAGABQ6PD74 315 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 BHLHB9Q6PI77 547 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 ZPLD1Q8TCW7 415 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 NUDT8Q8WV74 236 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 JADE3Q92613 823 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 G6PC3Q9BUM1 346 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 DPY30Q9C005 99 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 PIGUQ9H490 435 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.6■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 MED12LQ86YW9 2145 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 HSPB2A8KAH6 182 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 C17orf51A8MQB3 221 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 ZIC3O60481 467 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 ANGPTL1O95841 491 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 TBXA2RP21731 343 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 KIR3DL1P43629 444 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 LHX2P50458 406 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 WNT3P56703 355 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 TP53BP2Q13625 1128 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 RCAN2Q14206 197 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 HSPB2Q16082 182 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 PGS1Q32NB8 556 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 SFXN2Q96NB2 322 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 UCN2Q96RP3 112 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 CALHM2Q9HA72 323 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 AIG1Q9NVV5 245 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 PDZD2O15018 2839 aa15.58■□□□□ 0.09
HERC3-214ENST00000601319 A0A1W2PQD3 144 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 LINC01387J3KSC0 135 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 CFLARO15519 480 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 SCN2BO60939 215 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 ZNF708P17019 499 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 MSX1P28360 303 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 STX5Q13190 355 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 BCL2A1Q16548 175 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 APOOLQ6UXV4 268 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 ZAR1Q86SH2 424 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 MARCH3Q86UD3 253 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 MISPQ8IVT2 679 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 OR4C3Q8NH37 302 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 CDS1Q92903 461 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 ARL8AQ96BM9 186 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 DSN1Q9H410 356 aa15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 E9PBE3 544 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 H0Y3Z8 333 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 PRF1P14222 555 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 SOAT1P35610 550 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 CLDN18P56856 261 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-214ENST00000601319 ANXA8L1Q5VT79 327 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms