RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 FIGLAQ6QHK4 219 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 DEF8Q6ZN54 512 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 STX19Q8N4C7 294 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5D16Q8NGK9 328 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 KCMF1Q9P0J7 381 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 A3GALT2U3KPV4 340 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf74A8MZ97 194 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 B3GALT2O43825 422 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10H3O60404 316 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAPK10P53779 464 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 SZRD1Q7Z422 152 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM48Q8IWZ4 208 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4D11Q8NGI4 311 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 DACH2Q96NX9 599 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A4EQ96PG1 132 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GNT4Q9C0J1 378 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 ENTPD8Q5MY95 495 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM107Q6UX40 140 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K14Q8NGD5 310 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8J1Q8NGP2 316 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC37A2Q8TED4 501 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 EVA1AQ9H8M9 152 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A19Q9HC21 320 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 HMG20AQ9NP66 347 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 FOXJ2Q9P0K8 574 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT52Q9Y366 437 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SPACA6W5XKT8 324 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 FCRL6Q6DN72 434 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf94Q6P1W5 598 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL35Q6PF15 583 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF44Q7L0R7 432 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF843Q8N446 348 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 RCBTB1Q8NDN9 531 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4D9Q8NGE8 314 aa23.67■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 GIMAP5Q96F15 307 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23.67■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC38A1Q9H2H9 487 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNPO2LQ9H987 977 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL28Q9NXS3 571 aa23.67■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC13A4Q9UKG4 626 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa23.66■■□□□ 1.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 FEN1P39748 380 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKAG1P54619 331 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP2Q05923 314 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TIGD6Q17RP2 521 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM214AQ32MH5 1076 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 GPAT3Q53EU6 434 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 DTX1Q86Y01 620 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 KCT2Q8NC54 265 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL6Q8WZ60 621 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 LGALS12Q96DT0 336 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHA8Q96JA3 519 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC74BQ96LY2 380 aa23.66■■□□□ 1.38
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