RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ELK1P19419 428 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB3BP20337 219 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 WEE1P30291 646 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LCN1P31025 176 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 AVPR1BP47901 424 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXK2Q01167 660 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CAP1Q01518 475 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LGALS3BPQ08380 585 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPB2Q16082 182 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 Q5BKY6 102 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ARSIQ5FYB1 569 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TOR2AQ5JU69 321 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 IDNKQ5T6J7 187 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NIPAL3Q6P499 406 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT74Q7RTS7 529 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NAXDQ8IW45 347 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LNX2Q8N448 690 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CHST14Q8NCH0 376 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NSMAFQ92636 917 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A12Q96S37 553 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CD180Q99467 661 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ALG8Q9BVK2 526 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TMED9Q9BVK6 235 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GSX2Q9BZM3 304 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF32Q9H0A6 362 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CD93Q9NPY3 652 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CMC2Q9NRP2 79 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA2Q9UM82 520 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GABRQQ9UN88 632 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0A6YYJ9 748 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0G2JMP0 313 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CDHR4A6H8M9 788 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 URADA6NGE7 173 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 UNC119BA6NIH7 251 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R233 179 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R3H8 397 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 FLRT2O43155 660 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 FZD7O75084 574 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA7AO75326 666 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR7A10O76100 309 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ADH1CP00326 375 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 IL5P05113 134 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF3P17036 446 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SYN1P17600 705 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DNASE1P24855 282 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PDHA2P29803 388 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 UQCRC1P31930 480 aa7.22□□□□□ -1.25
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