RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		U3KQV3	271 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0G2JPF8	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0J9YVX5	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	URAD	A6NGE7	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		E9PQ18	207 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		M0QYG6	137 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FAAH	O00519	579 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX4	O95219	450 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf47	O95873	294 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK1	P06493	297 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OCM2	P0CE71	109 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MPI	P34949	423 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGA	P37287	484 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RY2	P41231	377 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	XCR1	P46094	333 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	BDKRB1	P46663	353 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ENTPD1	P49961	510 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB28	P51157	221 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	IST1	P53990	364 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	VLDLR	P98155	873 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SPIB	Q01892	262 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RELA	Q04206	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ILK	Q13418	452 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	GPM6B	Q13491	265 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RUNX3	Q13761	415 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF234	Q14588	700 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ODF1	Q14990	250 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NR1D2	Q14995	579 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CTF1	Q16619	201 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DCST1	Q5T197	706 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73

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