RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RAB31Q13636 194 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TFDP2Q14188 446 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DPYSL3Q14195 570 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD55Q3KP44 614 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 COX19Q49B96 90 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SBK1Q52WX2 424 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PIGGQ5H8A4 983 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CTSL3PQ5NE16 218 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PPM1LQ5SGD2 360 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CERCAMQ5T4B2 595 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MANEALQ5VSG8 457 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 REEP3Q6NUK4 255 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BTNL3Q6UXE8 466 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DLEU7Q6UYE1 221 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 S100A7AQ86SG5 101 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GPBP1Q86WP2 473 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ANGPTL5Q86XS5 388 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CRLF3Q8IUI8 442 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FUNDC1Q8IVP5 155 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GPC2Q8N158 579 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MTURNQ8N3F0 131 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CERS5Q8N5B7 392 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TEX26Q8N6G2 289 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR56A1Q8NGH5 318 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR5D13Q8NGL4 314 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR5H6Q8NGV6 325 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SPPL2AQ8TCT8 520 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SNX33Q8WV41 574 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ERGIC1Q969X5 290 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OTULINQ96BN8 352 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM10Q96HG1 83 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R16AQ96I34 528 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CPB2Q96IY4 423 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LRR1Q96L50 414 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SFXN2Q96NB2 322 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TSSK3Q96PN8 268 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CMKLR1Q99788 373 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CPNE1Q99829 537 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35A5Q9BS91 424 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NICN1Q9BSH3 213 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MRI1Q9BV20 369 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KATNB1Q9BVA0 655 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ACTRT3Q9BYD9 372 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC2Q9BYS8 371 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UCK2Q9BZX2 261 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 STRADBQ9C0K7 418 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CHST8Q9H2A9 424 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GAREM1Q9H706 876 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DCLRE1BQ9H816 532 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 WDR54Q9H977 334 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HHATLQ9HCP6 504 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT9Q9HCQ5 603 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MYNNQ9NPC7 610 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FZD3Q9NPG1 666 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM138Q9NPI0 162 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ASB6Q9NWX5 421 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ALKBH4Q9NXW9 302 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TREM2Q9NZC2 230 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MIOXQ9UGB7 285 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SMPXQ9UHP9 88 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 POU2F3Q9UKI9 436 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL3Q9UKT7 428 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PADI3Q9ULW8 664 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ICKQ9UPZ9 632 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MOKQ9UQ07 419 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms