RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO30	Q8TB52	745 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A6	Q92581	669 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA4	P78363	2273 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRB8	838 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK2	O95069	426 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA4L	O95757	839 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPS1L1	P21108	318 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	DIO3	P55073	304 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	EMX2	Q04743	252 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXF2	Q12947	444 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CPTP	Q5TA50	214 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SZRD1	Q7Z422	152 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZAR1	Q86SH2	424 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C3	Q8NH37	302 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT2B	Q93097	391 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PGM2	Q96G03	612 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SORT1	Q99523	831 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TM9SF2	Q99805	663 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF559	Q9BR84	538 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ASIC5	Q9NY37	505 aa		19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	19.69	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG1L2	C9J202	215 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	HCRTR2	O43614	444 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RCBTB2	O95199	551 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGPTL1	O95841	491 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	G6PD	P11413	515 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OPRM1	P35372	400 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN15	P56746	228 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SMU1	Q2TAY7	513 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT10	Q86SR1	603 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NATD1	Q8N6N6	113 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	GIN1	Q9NXP7	522 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	HAO1	Q9UJM8	370 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZWINT	O95229	277 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	HK1	P19367	917 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TBXA2R	P21731	343 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCRC1	P31930	480 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX19	P40855	299 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	DGKQ	P52824	942 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MYBPH	Q13203	477 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB9	Q96C00	473 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	STAC	Q99469	402 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2M5	A3KFT3	312 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01387	J3KSC0	135 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ALOX5	P09917	674 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PEPD	P12955	493 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	LCN1	P31025	176 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PRIM2	P49643	509 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN8	P56748	225 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RAET1L	Q5VY80	246 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CROCCP2	Q86T23	111 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	COX18	Q8N8Q8	333 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPH	Q9H3R5	247 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PPP4C-205	ENST00000563200	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		19.67	■□□□□ 0.74

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