RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558131.1

RPL28-205, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RPL28, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-205ENST00000558131 SDC1P18827 310 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 SLC6A8P48029 635 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 OCRLQ01968 901 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 HSPB3Q12988 150 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PDE7AQ13946 482 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 IMPG1Q17R60 797 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 Q6ZSR9 355 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ZNF550Q7Z398 422 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 GALNT10Q86SR1 603 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 OXSMQ9NWU1 459 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 NTMQ9P121 344 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 LINC01387J3KSC0 135 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 TBX19O60806 448 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 THBDP07204 575 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 UROSP10746 265 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ACP2P11117 423 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 NID1P14543 1247 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 RFX3P48380 749 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 IFT20Q8IY31 132 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 OR4C3Q8NH37 302 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 FAM110BQ8TC76 370 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ARSGQ96EG1 525 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PIP5K1AQ99755 562 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 EQTNQ9NQ60 294 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 DSCAMO60469 2012 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ALG1L2C9J202 215 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 H3BQF6 201 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PDPK1O15530 556 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 GMFGO60234 142 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 NGFRP08138 427 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 INHBBP09529 407 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 POU2F1P14859 743 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ZNF17P17021 662 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 GABRA3P34903 492 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CRHR1P34998 444 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 NAA20P61599 178 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 LTBQ06643 244 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PCLAFQ15004 111 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CCDC153Q494R4 210 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 Q5PR19 223 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 SHEQ5VZ18 495 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CCT7Q99832 543 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 C1orf109Q9NX04 203 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 VDAC3Q9Y277 283 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 C7orf72A4D263 438 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CASKO14936 926 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 SEC22BO75396 215 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PRPS2P11908 318 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 DUSP5Q16690 384 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 LIPMQ5VYY2 423 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 KANK2Q63ZY3 851 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 TDRPQ86YL5 185 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 FBXO30Q8TB52 745 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 POC1BQ8TC44 478 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 SLC9A6Q92581 669 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 MED18Q9BUE0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL28-205ENST00000558131 TTC36A6NLP5 189 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms