RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	AGR3	Q8TD06	166 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SFXN2	Q96NB2	322 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TRIB1	Q96RU8	372 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	STAC	Q99469	402 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DSN1	Q9H410	356 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DKKL1	Q9UK85	242 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	HIVEP1	P15822	2718 aa		10.4	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	F8	P00451	2351 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQD3	144 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PRB8	838 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CLCA1	A8K7I4	914 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137		H0Y3Z8	333 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SCO2	O43819	266 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KCNK2	O95069	426 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ANGPTL1	O95841	491 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CRH	P06850	196 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ALOX5	P09917	674 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	BMP5	P22003	454 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PRIM2	P49643	509 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	STAR	P49675	285 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SLC18A1	P54219	525 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	WNT3	P56703	355 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KRTAP10-9	P60411	292 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	DUSP5	Q16690	384 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MARCH3	Q86UD3	253 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OR4C3	Q8NH37	302 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SFXN5	Q8TD22	340 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PIK3R3	Q92569	461 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MOAP1	Q96BY2	351 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SORT1	Q99523	831 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZNF559	Q9BR84	538 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	BTBD2	Q9BX70	525 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PIGU	Q9H490	435 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	EQTN	Q9NQ60	294 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MED11	Q9P086	117 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137		A0A087WZY1	265 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	C7orf72	A4D263	438 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KRT16	P08779	473 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	G6PD	P11413	515 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	HK1	P19367	917 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SLC1A6	P48664	564 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PRKAG1	P54619	331 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CLDN15	P56746	228 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SORD	Q00796	357 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	CDC73	Q6P1J9	531 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	MISP	Q8IVT2	679 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	SLC9A6	Q92581	669 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-223	ENST00000551137	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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