RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NATD1	Q8N6N6	113 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	COX18	Q8N8Q8	333 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SFXN5	Q8TD22	340 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CDS1	Q92903	461 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TEX37	Q96LM6	180 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DKKL1	Q9UK85	242 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CREBBP	Q92793	2442 aa		18.93	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	KIT	P10721	976 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CPN1	P15169	458 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	IGFBP2	P18065	325 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	EPHA3	P29320	983 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PRIM2	P49643	509 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	LHX2	P50458	406 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TTMP	Q5BVD1	217 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CDC73	Q6P1J9	531 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SFXN2	Q96NB2	322 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	STAC	Q99469	402 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DPY30	Q9C005	99 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		18.92	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ALG1L2	C9J202	215 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	HDAC3	O15379	428 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ANGPTL1	O95841	491 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NGFR	P08138	427 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CLDN18	P56856	261 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ANKRD46	Q86W74	232 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	LACC1	Q8IV20	430 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	BTBD2	Q9BX70	525 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	PIGU	Q9H490	435 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	AIG1	Q9NVV5	245 aa		18.91	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CD8B2	A6NJW9	211 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996		C9JVG2	144 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	CFLAR	O15519	480 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	GMFG	O60234	142 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TBXA2R	P21731	343 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	MSX1	P28360	303 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	IL12A	P29459	219 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SOAT1	P35610	550 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NME5	P56597	212 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SRY	Q05066	204 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ATG16L1	Q676U5	607 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	GATS	Q8NAP1	163 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TESC	Q96BS2	214 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	TRIB1	Q96RU8	372 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	GIN1	Q9NXP7	522 aa		18.9	■□□□□ 0.62
CS-222	ENST00000550996	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-222	ENST00000550996	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-222	ENST00000550996	ZNF195	O14628	629 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-222	ENST00000550996	C1QC	P02747	245 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-222	ENST00000550996	NPIPA8	P0DM63	369 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-222	ENST00000550996	ZNF708	P17019	499 aa		18.89	■□□□□ 0.61
CS-222	ENST00000550996	HK1	P19367	917 aa		18.89	■□□□□ 0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms